フリーアプリケーションTreeViewをダウンロード．樹の構造をテキスト表現する方法もいくつかあるが、

(B1:0, (((B3:0, B5:2.00000):0, B2:1.00000):0, B4:0.00000):1.00000);

は、Newick書式(URL)と呼ばれ、樹を描くさまざまなアプリケーションで使われています．

TreeViewでは、このNewick書式のテキストファイルを読み込んで樹を表示することができる。フリーの統計ソフト「R」でもNewick書式がハンドリングでき、系統図が描ける．以下その方法のメモ

Rのパッケージ　ape をインストールする。

# library(ape)

apeに含まれる関数　read.treeにて，Newick書式が書かれたテキストファイル”test.txt”を読み込む．ただし，ワーキングディレクトリにファイルを置いていなければ、ファイルにパスを通す必要がある．

# test.tree <- read.tree(file=”test.txt”)

これによって，phyloというオブジェクトに取り込まれたので，ハンドリング可能である．系統樹を描くには

# plot(test.tree)